透明度や瓶詰めしやすくするためにメーカーによっては、 温度を60℃以上に上げて減圧釜で処理する方法がとられています。
60℃以上の高温で加熱するとはちみつに含まれる本来の貴重な栄養素や香りなどが破壊されてしまうのです。

良質な天然はちみつは遅かれ早かれ白く結晶します。
結晶とは、はちみつに含まれる成分のひとつである花粉を中心としてブドウ糖が結晶したものです。
ブドウ糖が含まれる比率によって結晶しやすさが変わります。 菜の花、レンゲなどはブドウ糖の比率の高いハチミツは結晶しやすく、 アカシアなどは果糖の比率が高いので結晶しにくい性質をもっています。 天然のはちみつは開封後も常温で保管でき、 結晶凝固したときは温かい場所においておけば融解し、 時間がたつとまた結晶します。
ハチミツの表面にできる白い層（空気の泡）や 瓶の内側につく粉々なども結晶の一種で自然の現象ですから問題はありません。

清涼飲料、ドリンク剤、ケーキ、菓子、 アメなどに使われていますがハチミツの匂い、色調を取り除いたもので、 ビタミンミネラルなどハチミツに含有されている栄養素は精製工程のなかですべて除去されてしまっています。

同じ糖分を供給する食品でも、はちみつと砂糖は根本的に異なります。
砂糖は人が畑で栽培したサトウキビやテンサイから抽出され工業的に精製したものですが、 はちみつは自然に生えている草木の花々からみつばちが蜜を集めて貯蔵したものです。 すべての精製過程をみつばちにまかせておく、まさにオーガニックな食材です。